"הפרקים המושעים" הם פרקים ששודרו ביפן וכשהועברו לשידור בארצות אחרות, צונזרו בשל תוכנם הפרובוקטיבי.
ישנם פרקים שהורשו לצפייה לאחר זמן מה, ישנם פרקים שצונזרו לצמיתות ויש גם קטעים נבחרים שצונזרו מהפרקים.

הפרקים הגנוזים :

מספר הפרק: 18 | שם הפרק : היפה והחוף (Beauty and the Beach)

סיבה לגניזה: בפרק זה ג'יימס הוצג בתור מישהי עם מחשוף עמוק כדי לנצח את תחרות היופי שנערכה בעיר.
זה למה כאשר חברת WBkids שידרה את הפרק בארה"ב, הוא שודר עם מקטעים ארוכים של צנזורה בתוכו.

מס' פרק: 19 | שם הפרק : טנטקול וטנטקרול (Tentacool & Tentacruel)
סיבה לגניזה: בפרק זה הייתה יותר מדי אלימות, גם מצד בני האדם וגם מצד הפוקימונים.
מצד בני האדם הוצגו יותר מדי כלי נשק, ומצד הפוקימונים היה הרס קטלני ובו נהרסו כל הבניינים.
חברת KidsWB החליטה לצנזר את שידור הפרק לאחר אירועי '11 בספטמבר 2001'.
הפרק חזר לשידור בידיה של החברה Cartoon Network וגם נכלל בDVD של אותה עונה.

מס' הפרק: 35 | שם הפרק : האגדה של דרטיני (The Legend of Dratini)

סיבה לגניזה: בפרק זה הופיעו מספר רב של איומים עם אקדח, דבר שצונזר בכל מדינה מלבד יפן.
טריוויה: זהו הפרק שבו אש לוכד את טאורוס, כך שבהתחשב שהפרק צונזר, לכידה זו התרחשה באופן פילאי.

מס' הפרק: 38 | שם הפרק : פוריגון החייל הממוחשב (Electric Soldier Porygon)

סיבה לגניזה: בפרק זה צוות רוקט נלחם נגד אש וחבריו. במהלך הלחימה, צוות רוקט שיגר אל אש מתקפת טילים, ופיקאצ'ו תקף אותם במתקפת חשמל, דבר שיצר הבהובים מהירים מאוד בתוספת צבע מאוד בהיר. צופים בעלי לקויות אפילפסיה לקו בעיוורון זמני וחלקם גם איבדו את הכרתם. הפרק מאז נגנז בכל העולם, הפוקימון 'פוריגון' נאסר מכל השתתפות בסדרה (למרות שיש לו התפתחויות) והמתקפה של פיקאצ'ו קיבלה גוונים כהים יותר.
הערה: אם אינכם חולי אפילפסיה, אתם יכולים לצפות בפרק בלי חשש.

מס' הפרק : 232 | שם הפרק : מערת הקרח (The Ice Cave)

סיבה לגניזה : הפרק הושעה מכיוון שאישה בשם קרול וויט'רפורד אמרה שהפוקימון "ג'ינקס" הוא מן פוקימון שמוצג בתור סטראוטיפ גזעני.
היא טענה שג'ינקס בא לייצג את האישה השחורה (אפרו-אמריקאית) ולעשות ממנה צחוק. אחרי מקרה זה, הוחלט לשנות את צבעה של ג'ינקס לסגול.

מס' הפרק : 377 | שם הפרק : רעידת אי הקרבות – ברבוץ' נגד ויסקש (Shaking Island Battle! Barboach VS Whiscash)

סיבה לגניזה : הפרק הזה לא שודר באף מקום, אפילו לא ביפן, וזאת מכיוון שבזמנו הייתה רעידת אדמה חמורה ביפן, ובפרק הזה מתרחשת רעידת אדמה.

קרדיט: Jynx